ToBRFV : Détection précoce et repérage du point d’entrée du virus

Le virus du fruit rugueux brun de la tomate (ToBRFV) se répand de plus en plus. En cas d’infection, il est important d’être préparé, de comprendre l’infection virale et de gérer sa propagation .

Une infection par le virus ToBRFV qui n’est pas gérée correctement peut avoir un impact important sur la qualité et le rendement des plantes. Selon Harmen Hummelen, Responsable Qualité Production chez Bayer, il est important d’être préparé et de comprendre l’infection virale afin d’atténuer efficacement sa propagation ou de prévenir une épidémie potentielle.

Reconnaissance dans la serre

Il n’est pas facile de reconnaître une infection précoce, en partie parce que la plupart des gens n’ont jamais vu la maladie auparavant. Il existe quelques lignes directrices générales pour faciliter la détection précoce et la reconnaissance du ToBRFV, et une personne expérimentée qui peut « lire » les plantes est l’une des aides les plus précieuses.

Cette personne est plus susceptible de voir les plantes qui ne sont pas « normales » pour une variété particulière ou une période de l’année (par exemple, celles qui ont une couleur ou une forme légèrement différente). Ces symptômes peuvent ne pas être directement liés au virus du ToBRFV, car ils peuvent souvent ressembler à une carence en engrais ou à d’autres facteurs de stress.

Par exemple, l’un des symptômes peut être que la plante est un peu plus courte, sans raison claire. Ces plantes, ou leurs voisines, peuvent avoir des fruits qui ne mûrissent pas normalement. Certains fruits, en particulier au sommet d’une grappe, mûrissent plus tard ou la maturation est plus inégale, peut-être avec un peu plus de tâches. Le haut de la plante est peut-être d’un vert un peu plus pâle ? Ce sont là des symptômes qui peuvent être causés par de nombreux facteurs, mais qui peuvent également indiquer la présence du ToBRFV.

Le problème est que dans certains cas, le virus ne provoque aucun symptôme sur la plante et ne se manifeste que sur les fruits. Cela semble se produire surtout dans les cultures plus anciennes, où l’on n’observe pratiquement aucun symptôme, mais où le virus est présent. Cela augmente le risque qu’une infection manquée se propage au cycle de culture suivant.

Il est donc très important, si quelque chose ne semble pas normal, de procéder à un nouveau contrôle plus minutieux. La dernière étape pour déterminer si le virus ToBRFV est présent est de réaliser un test.

Feuilles de tomates infectées par le ToBRFV à gauche et feuilles saines à droite (cf. Kai-Shu Ling, USDA-ARS) Le jaunissement, les bulles, la mosaïque et les marbrures, le rétrécissement de la fougère sont tous des symptômes du ToBRFV sur les feuilles.

Test

« Une méthode simple et efficace pour tester la présence du virus ToBRFV consiste à prélever un échantillon du calice du fruit », explique Leonie Hogendonk, responsable du développement De Ruiter.

Un test en laboratoire ou un test rapide peut indiquer la présence d’une infection. Dans les deux cas, il faut veiller à prélever plusieurs parties de la plante, par exemple le calice et les pousses en croissance active dans un seul échantillon, car le virus peut ne pas être présent dans toutes les parties de la plante. Si le premier échantillon ne confirme pas le diagnostic visuel, n’hésitez pas à produire un autre échantillon à partir d’une deuxième plante ou à combiner plusieurs plantes en un seul échantillon.  

Le diagnostic de l’eau de drainage est également un bon moyen de détecter une infection à un stade précoce. Des producteurs belges ont analysé cette eau en laboratoire et, dans certains cas, une infection virale peut être détectée jusqu’à 10 semaines avant l’apparition de symptômes visuels.

Diagramme montrant la progression de la mosaïque (en noir) dans un plant de tomate moyennement jeune. Basé sur un test effectué sur des plants de tomates Dwarf Champion d’environ 38 cm de haut, poussant dans des pots de 15 cm dans une serre non battue. La foliole inoculée est ombrée.

Figure 1. Le virus n’est pas réparti uniformément sur l’ensemble de la plante. Un virus pénètre quelque part dans la plante et se déplace ensuite avec le phloème vers les racines. Presque en même temps, il se déplace également vers la partie supérieure de la plante, jeune et en pleine croissance, et il peut s’écouler un certain temps avant que le reste de la plante ne soit infecté.

Il convient d’être prudent lors des tests effectués au début de la saison après une infection antérieure, car il est possible que l’ARN du virus mort de la saison précédente soit détecté. Cependant, si la quantité de virus augmente, il est clair qu’il s’agit de virus vivant qui se développe dans les plantes. 

La détection du virus doit être limitée à un certain bloc ou à une certaine section de la serre, et une telle détection précoce permet de prendre des mesures supplémentaires et donc de réduire la propagation du virus dans la serre ou la pépinière.

Voie d’entrée du virus dans la serre

Lorsque les premières plantes sont détectées, la question suivante est de savoir pourquoi l’infection s’est déclarée à cet endroit ; dans la pratique, il n’est pas toujours possible de répondre à cette question. Le virus est invisible et, même avec de bonnes mesures de prévention et d’hygiène, de faibles niveaux de virus peuvent être introduits à un moment donné. L’endroit où se trouve le virus n’est pas nécessairement le point d’entrée.

Le virus peut entrer par des personnes, du matériel ou des animaux. On ne sait pas encore combien de temps il faut au virus pour infecter la culture à partir du vecteur (ce qui porte le virus) et cela peut aller de 10 minutes à un jour ou plus. Cela signifie que le virus peut apparaître pour la première fois au milieu de la serre, même s’il a été introduit ailleurs. Le virus a également besoin d’une plante suffisamment sensible pour permettre l’infection.

Tous ces facteurs inconnus font qu’il est difficile de retracer le point d’entrée initial. C’est pourquoi il est très important d’avoir des niveaux élevés d’hygiène dans les serres et les cultures dès le début et pendant la saison de culture.

Recul par rapport à la date d’infection

Dans certaines expériences, les symptômes du virus apparaissent chez les jeunes plantes après seulement 10 jours. Cependant, chez les plantes plus âgées, il est possible qu’aucun symptôme clair ne soit observé pendant des mois, voire jusqu’à la fin de la culture. Par conséquent, trouver cette première plante est un grand défi. Il est très probable que la première plante infectée soit l’une des plantes voisines et, au moment où la personne découvre les symptômes, l’infection peut concerner 10 à 20 plantes au total.

Un bon dépistage pour trouver le virus le plus tôt possible et une bonne hygiène pour réduire la propagation du virus sont essentiels pour garder autant de plantes que possible en bonne santé jusqu’à la fin du cycle de culture.

Source : VegetablesBayer

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